জেল পেনের কালি তৈরি করা হয় পানি ও বায়োপলিমারের মিশ্রণ দিয়ে, আর ঘন করার জন্য এতে যুক্ত করা হয় Copper Phthalocyanine ও Iron oxide। এই পদার্থগুলো খোলা অবস্থায় সহজেই বাতাসে মিশে যেতে পারে। এ কারণে জেল পেনের ক্যাপ অনেকদিন ধরে খোলা রেখে দিলে কালি শুকিয়ে যায়।
জেল পেনের কালির সান্দ্রতা ( Viscosity ) অনেক বেশী থাকে। সান্দ্রতা বেশী হওয়ার কারণে কলমের নিবে কালি কম আসে। সান্দ্রতা বেশী থাকে বলে কলমের ভিতরে কালির গতি বাধাপ্রাপ্ত হয়। মসৃণ তলে জেল পেন দিয়ে লিখে সাচ্ছন্দ্য বোধ হয়। তবে জেল পেন দিয়ে কখনোই ভেজা কাগজে লিখবে না কেননা ভেজা কাগজের উপর জেল পেন দিয়ে লিখা হলে, কালি পুরো কাগজে ছড়িয়ে যায়।
বাতাসে মিলিয়ে যাওয়া ছাড়াও আরও অনেক কারণে জেল পেন কাজ করা বন্ধ করে দিতে পারে। জেল পেনের কালি বেশ গাঢ় হওয়ার কারণে বেশীদিন ব্যবহার না করলে কালি জমাট বেঁধে যায়। এছাড়া কলমের নিবে কোনকিছু আটকে থাকলে কালি বের হতে পারে না বলে কলম কাজ করে না। কালি জমাট বেঁধে গেলে দু’হাতে কলমটি ধরে জোরে কিছুক্ষণ ঘষা দিয়ে দেখতে পারো, অথবা কলমটি রোদে কিছুক্ষন রেখে দিলেও কাজ হবে।(champs)
